L'établissement du bilan des entrées et sorties de nitrates dans quelques lacs de gravières ainsi que la mesure directe de la dénitrification par émission de N2O (méthode à l'acétylène) ont permis d'évaluer l'activité dépolluante de ces lacs vis-à-vis de la nappe phréatique de la Garonne.L'activité dénitrifiante la plus élevée a été mesurée dans un lac ancien, non colmaté, artificiellement eutrophisé. Par contre, les gravières anciennes colmatées sont sans effet.Des surfaces considérables de plan d'eau sont nécessaires afin d'épurer des débits suffisants en vue de l'alimentation des captages d'eau potable.

La disparition des nitrates d'une nappe superficielle circulant sous un bois d'aulnes et la mesure directe de l'émission de N2O (méthode à l'acétylène) montrent la capacité de ce type de végétation à améliorer la qualité des eaux souterraines. L'activité de ce système semble atteindre une efficacité plus élevée que celle des eaux de surface en raison de la conjonction de facteurs favorables : fourniture de carbone organique dégradable, conditions d'anaérobiose, transport de masse des nitrates.Etant donné l'efficacité du processus, il est suggéré un réaménagement en aulnaie des lacs de gravières situés en amont des captages d'eau potable, afin d'en améliorer la qualité des eaux.