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Morphological and genetic characterization of Ganjam sheep

Published online by Cambridge University Press:  06 May 2010

R. Arora ,
S. Bhatia  and
A. Jain
R. Arora
Affiliation:
Sheep Genomics Laboratory, Animal Genetics Division, National Bureau of Animal Genetic Resource, P.O. Box 129, Karnal-132001 Haryana, India
S. Bhatia*
Affiliation:
Sheep Genomics Laboratory, Animal Genetics Division, National Bureau of Animal Genetic Resource, P.O. Box 129, Karnal-132001 Haryana, India
A. Jain
Affiliation:
Sheep Genomics Laboratory, Animal Genetics Division, National Bureau of Animal Genetic Resource, P.O. Box 129, Karnal-132001 Haryana, India
*
Correspondence to: S. Bhatia, Sheep Genomics Lab., Animal Genetics Division, National Bureau of Animal Genetic Resource, P.O. Box 129, Karnal-132001, Haryana, India. email: bhatias11@yahoo.com
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Summary

Ganjam is an important sheep breed in the Orissa State in the eastern region of India. They are reared mainly for meat. The present study was conducted to characterize the Ganjam breed both phenotypically and genotypically at the DNA level using microsatellite markers. A survey was conducted in the breeding tract to study the habitat, body biometry, management practices and reproductive and productive performance of Ganjam sheep. A total of 604 animals were studied for morphological characteristics. The animals are medium sized with hairy fleece. Their coat colour varies from brown to dark tan. The average flock size is 35. Measurements were recorded for body weight, body length, height at withers, chest girth, ear length and horn length in 366 adult animals. A set of 25 microsatellite markers was used to assess the genetic variability in 50 DNA samples extracted from randomly collected blood samples of unrelated Ganjam sheep across their breeding tract. A total of 137 alleles were identified across the 25 markers. The allele diversity (5.48), mean observed heterozygosity (0.623) and gene diversity (0.685) estimates elucidated substantial genetic diversity within the Ganjam breed. The Mode Shift Test implied that a reduction in the effective population size or a recent genetic bottleneck was very unlikely in this indigenous breed of sheep. The within population inbreeding estimate values for the investigated population (0.087) showed a low rate of inbreeding.

Résumé

La race Ganjam est une race ovine importante de l'état d'Orissa, dans la région orientale de l'Inde, élevée principalement pour la viande. La présente étude a été conduite pour caractériser la race Ganjam d'un point de vue phénotypique ainsi que génotypique au niveau de l'ADN en utilisant les marqueurs microsatellites. L'enquête a été effectuée dans la zone d'élevage pour étudier l'habitat, la biométrie corporelle, les pratiques de gestion, la performance de reproduction et de production du mouton Ganjam. Au total, on a étudié les caractéristiques morphologiques de 604 animaux. Les animaux ont une taille moyenne et une toison velue. La couleur de la robe varie du marron au fauve foncé. La taille moyenne des troupeaux est de 35 animaux. Les mensurations ont été enregistrées pour le poids corporel, la longueur du corps, la hauteur au garrot, la circonférence de poitrine, la taille des oreilles et des cornes de 366 animaux adultes. Un assortiment de 25 marqueurs microsatellites a été utilisé pour évaluer la variabilité génétique dans 50 échantillons d'ADN extraits du sang recueillis au hasard parmi des moutons Ganjam sans relation dans leur zone d'élevage. Au total, on a identifié 137 allèles dans les 25 marqueurs. Les estimations de la diversité allélique (5,48), de l'hétérozygosité moyenne observée (0,623) et de la diversité génétique (0,685) ont mis en évidence une diversité génétique substantielle au sein de la race Ganjam. Le test de déplacement de mode laisse supposer que la réduction de la taille effective de population ou un goulet d'étranglement génétique récent était très improbable dans cette race indigène de moutons. Dans le cadre de la consanguinité de la population, les estimations (FIS) pour la population examinée (0,087) ont indiqué un faible taux de consanguinité.

Resumen

La Ganjam es una importante raza ovina del Estado de Orissa de la región oriental de la India, criada principalmente para la producción de carne. El presente estudio fue realizado para caracterizar la raza Ganjam fenotípica y genéticamente -a nivel de ADN usando marcadores moleculares de tipo microsatélite. Se llevó a cabo una encuesta como parte de la mejora genética realizada con objeto de estudiar el hábitat, la biometría corporal, las prácticas de manejo, así como los rendimientos reproductivos y productivos de la oveja de raza Ganjam. Se estudiaron las características morfológicas sobre un total de 604 animales. Los individuos de esta raza son de mediano tamaño y vellón abierto. El color del manto varía desde el castaño hasta el canela oscuro. El tamaño medio de los rebaños se sitúa en 35 ejemplares. Las medidas tomadas fueron el peso corporal, el diámetro longitudinal, la alzada a la cruz, el perímetro torácico, la longitud de la oreja y la del cuerno sobre un total de 366 animales. Un conjunto de 25 marcadores moleculares de tipo microsatélites fue utilizado para evaluar la variabilidad genética en 50 muestras de ADN extraídas aleatoriamente de muestras de sangre pertenecientes a ovejas de la raza Ganjam no emparentadas como parte de acciones encaminadas a su mejora genética. Se identificaron un total de 137 alelos diferentes a través de 25 marcadores moleculares. La diversidad de los alelos (5,48), heterocigosidad media observada (0.623) y la diversidad de genes (0,685) estimada, aclara que existe una gran diversidad genética dentro de la raza Ganjam. La prueba “Mode Shift” indica que tanto una reducción del tamaño efectivo de la población como un reciente cuello de botella de la población han sido muy poco probables en esta raza autóctona ovina. Asimismo, se observó un bajo nivel del endogamia dentro de la población objeto de estudio (0,087).

Keywords

Ganjam sheepgenetic characterizationIndiaphenotypical characterizationmouton GanjamIndcaractérisation phénotypiquecaractérisation génétiqueOveja GanjamIndiacaracterización fenotípicacaracterización genética
Type
Research Article
Information
Animal Genetic Resources/Resources génétiques animales/Recursos genéticos animales , Volume 46 , April 2010 , pp. 1 - 9
Copyright
Copyright © Food and Agriculture Organization of the United Nations 2010

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