Hostname: page-component-78c5997874-s2hrs Total loading time: 0 Render date: 2024-11-10T11:52:18.219Z Has data issue: false hasContentIssue false

Principal component analysis of cephalic morphology to classify some Pyrenean cattle

Published online by Cambridge University Press:  18 June 2012

P.-M. Parés i Casanova*
Affiliation:
Departament de Producció Animal, ETSEA, Universitat de Lleida, E 25198 Lleida, Catalunya, Spain
I. Sinfreu
Affiliation:
Departament de Producció Animal, ETSEA, Universitat de Lleida, E 25198 Lleida, Catalunya, Spain
D. Villalba
Affiliation:
Departament de Producció Animal, ETSEA, Universitat de Lleida, E 25198 Lleida, Catalunya, Spain
*
Correspondence to: P.-M. Parés i Casanova, Departament de Producció Animal, ETSEA, Universitat de Lleida, Av. Alcalde Rovira Roure, 191, E 25198 Lleida, Catalunya, Spain. email: peremiquelp@prodan.udl.cat
Get access

Summary

Seven morphostructural traits namely head, face and skull widths and lengths and head depth of 300 cows belonging to seven different French and Spanish breeds were measured. The investigation aimed at grouping these cattle breeds according to their head conformation using principal component analysis. From the normalized varimax rotation, two principal components that accounted for 68.1 percent of the total variance were extracted. The first principal component, termed viscerocranium length component, had its loadings for face and head lengths and explained 49.9 percent of the generalized variance. Skull and head widths determined the second principal component, which contributed to 19.2 percent of the variance, and could be termed the component of the neurocranium width. There is a good deal of overlap between breeds although the Avileña breed shows an increasingly longer built skull in terms of face and skull lengths. The Blanca del Pallars breed appears significantly separated from alpine breeds but closely related to Gascon.

Résumé

On a mesuré sept caractères morphostructuraux (c'est-à-dire, largeur et longueur de la tête, de la face et du crâne, ainsi que profondeur de la tête) de 300 vaches appartenant à sept différentes races françaises et espagnoles. L'enquête visait à regrouper ces races de bovins selon la conformation de leur tête, en utilisant l'analyse en composantes principales. On a dégagé de la rotation varimax normalisée deux composantes principales qui représentaient 68,1 pour cent de la variance totale. La première composante principale, appelée composante de la longueur du viscérocrâne, qui mesurait la longueur de la face et de la tête, justifiait 49,9 pour cent de la variance généralisée. Les largeurs du crâne et de la tête ont défini la deuxième composante principale qui représentait 19,2 pour cent de la variance. On pourrait l'appeler la composante de la largeur du neurocrâne. Les races se chevauchent beaucoup, bien que la race Avileña présente la structure d'un crâne de plus en plus long sur le plan des longueurs de la tête et du crâne. La race Blanca del Pallars semble être sensiblement éloignée des races alpines, mais très proche de la race Gasconne.

Resumen

Se han medido siete caracteres morfoestructurales (anchura y longitud de la cabeza, de la cara y del cráneo, y la profundidad de la cabeza) a 300 vacas pertenecientes a siete razas francesas y españolas. El objetivo de la investigación estuvo centrado en el agrupamiento de estas razas de ganado de acuerdo a su conformación de la cabeza, utilizando análisis de componentes principales. De la rotación varimax normalizada, se extrajeron dos componentes principales que representaban el 68,1 percent de la variación total. El primer componente principal, denominado longitud viscerocranium, tenía peso específico para la longitud de la cara y de la cabeza, y explicaba el 49,9 percent de la varianza generalizada. La anchura del cráneo y de la cabeza determinó el segundo componente principal, lo que contribuía a un 19,2 percent de la varianza, y que podría denominarse como el componente anchura neurocranium. Existe un gran solapamiento entre las razas; aunque la Avileña muestra un cráneo cada vez más largo de acuerdo a la relación existente entre la longitud de la cara y la del cráneo. La raza Blanca del Pallars aparece muy separada del resto de las razas alpinas, pero cercana a la Gascón.

Type
Research Article
Copyright
Copyright © Food and Agriculture Organization of the United Nations 2012

Access options

Get access to the full version of this content by using one of the access options below. (Log in options will check for institutional or personal access. Content may require purchase if you do not have access.)

References

Achilli, A., Bonfiglio, S., Olivieri, A., Malusà, A., Pala, M., Kashani, B.H., Perego, U.A., Ajmone-Marsan, P., Liotta, L., Semino, O., Bandelt, H., Ferretti, L. & Torroni, A. 2009. The multifaceted origin of taurine cattle reflected by the mitochondrial genome. PLoS ONE, 4(6): e5753. doi: 10.1371/journal.pone.0005753.CrossRefGoogle ScholarPubMed
Avellanet, R., Aranguren-Méndez, J.A. & Jordana, J. 2002. Programa de recuperación de la raza bovina Pallaresa. III Congreso Ibérico sobre los Recursos Genéticos Animales, Madrid. El Arca, 5: 22.Google Scholar
Čítek, J., Panicke, L., Řehout, V. & Procházkovál, H. 2006. Study of genetic distances between cattle breeds of Central Europe. Czech J. Anim. Sci., 51(10): 429436.CrossRefGoogle Scholar
Hammer, Ø., Harper, D.A.T. & Ryan, P.D. 2001. PAST: paleontological statistics software package for education and data analysis. Palaeontologia Electronica, 4(1): 9 pp. (available at http://palaeo-electronica.org/2001_1/past/issue1_01.html).Google Scholar
Herrera, M. & Luque, M. 2009. Morfoestructura y sistemas para el futuro en la valoración morfológica. In Sañudo, C., ed. Valoración morfológica de los animales domésticos. Madrid, Minist. de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino.Google Scholar
Jordana, J., Ferrando, A., Marmi, J., Avellanet, R., Aranguren-Méndez, J.A. & Goyache, F. 2010. Molecular, genealogical and morphometric characterisation of the Pallaresa, a Pyrenean relic cattle breed: insights for conservation. Livestock Sci., 132: 6572.CrossRefGoogle Scholar
Kidd, K.K. & Pirchner, F. 1971. Genetic relationships of Austrian cattle breeds. Anim. Blood Grps Biochem. Genet., 2: 145158.CrossRefGoogle Scholar
Lorenzo-Seva, U. & Ferrando, P.J. 2006. FACTOR: a computer program to fit the exploratory factor analysis model. Behav. Res. Methods Instrum. Comput., 38(1): 8891.CrossRefGoogle ScholarPubMed
Marmi, J., Casas, M. & Jordana, J. 2005. Estudio de la estructura genética, a partir de su información genealógica, de una raza bovina en situación crítica de extinción: la vaca Pallaresa. V Simposio de Recursos Genéticos para América Latina y el Caribe. Montevideo (Uruguay). Libro Resúm., 110.Google Scholar
Martín-Burriel, I., Rodellar, C., Cañón, J., Cortés, O., Dunner, S., Landi, V., Martínez-Martínez, A., Gama, L.T., Ginja, C., Penedo, M.C.T., Sanz, A., Zaragoza, P. & Delgado, J.V. 2011. Genetic diversity, structure, and breed relationships in Iberian cattle. J. Anim Sci., 89: 893906.CrossRefGoogle ScholarPubMed
Parés, P.M. & Jordana, J. 2008. Zoometric measurements of cephalic conformation in adult bovine males and females (Bos Taurus). Veterinarija ir Zootechnika, 43(65): 7376.Google Scholar
Pariset, L., Mariotti, M., Nardone, A., Soysal, M.I., Ozkan, E., Williams, J.L., Dunner, S., Leveziel, H., Maróti-Agóts, A., Bodò, I. & Valentini, A. 2010. Relationships between Podolic cattle breeds assessed by single nucleotide polymorphisms (SNPs) genotyping. J. Anim. Breed. Genet., 127: 481488.CrossRefGoogle ScholarPubMed
Porter, V. 1991. Cattle. A handbook to the breeds of the world. Wiltshire, The Crowood Press.Google Scholar
Sambraus, H.H. 1992. A colour atlas of livestock breeds. London, Wolfe Publishing Ltd.Google Scholar
Sánchez, A. 1984. Razas bovinas españolas. Madrid, Publics. de Extensión Agraria.Google Scholar
Viana, J.L., Fernández, A., Iglesias Blanco, A. & Sánchez, L. 1998. Genetic variability and phylogenetic relationships between ten native cattle breeds from Galicia and the north of Portugal. Arch. Zootec., 47(177): 6171.Google Scholar
Yakubu, A. & Ayoade, J.A. 2009. Application of principal component factor analysis in quantifying size and morphological indices of domestic rabbits. Int. J. Morphol., 27(4): 10131017.CrossRefGoogle Scholar