Par les modifications qu'elle entraîne sur la pénétration de la lumière dans l'eau, l'agitation a un rôle négatif sur la production primaire phytoplanctonique de la zone littorale du lac du Bourget.

La durée des oscillations importe plus que leur amplitude. L'effet maximum est obtenu à 50 cm environ sous la surface de l'eau. L'homogénéisation des populations phytoplanctoniques qu'elle produit est également mise en évidence.

Le phytoplancton a été étudié sur la rivière Lot, de juillet 1972 à juillet 1973, sur 23 stations, en corrélation avec une étude physicochimique. Les caractéristiques géographiques, hydrologiques et physicochimiques sont brièvement données. Les populations algales sont étudiées par des comptages au microscope inversé. La liste des principales espèces est donnée : dans leur majorité, les espèces recensées sont fréquentes dans les milieux oligotrophes à β mésosaprobes. La dérive des algues benthiques est évaluée (pourcentage moyen du nombre total des cellules en suspension : 10 %). Diatomées et Euchlorophycées représentent plus de 90 % de la biomasse. La biomasse varie de 0,7 g/m3 en hiver à 9 g/m3 en été. Le cycle annuel du phytoplancton est à peu près semblable à celui des lacs tempérés. L'incidence des composantes physiques, chimiques et biologiques sur la croissance des algues est discutée. Nitrates, phosphates et silice ne semblent pas jouer un rôle de facteur limitant de la croissance du phytoplancton en été. Le développement estival des algues est lié aux faibles débits circulant sur la rivière canalisée.

Les migrations verticales de 9 espèces de Métazoaires (Crustacés et Rotifères) ont été observées en novembre dans un canal dont la profondeur maximale ne dépasse pas 2,60 m.

Les récoltes furent effectuées toutes les trois heures à trois niveaux différents, durant une période de 24 heures.

Brachionus calyciflorus, B. angularis, Polyarthra vulgaris, Filinia longiseta et Bosmina longirostris effectuent trois mouvements ascendants successifs qui surviennent respectivement avant et après l'aurore puis au crépuscule.

Une migration inversée a été observée pour Keratella quadrata (dont la densité maximale fut atteinte à proximité du fond vers 23 heures) et pour les nauplii de Cyclopidae qui migrent massivement vers la surface durant la période de plus forte illumination.

La distribution verticale du plancton était à peu près uniforme entre 23 heures et 2 heures du matin.

La durée du cycle vital de Drusus rectus s'allonge suivant la séquence : biotope déneigé en basse altitude (1 an) - biotope déneigé en haute altitude - biotope enneigé en haute altitude (2 ans). Les très basses températures déterminent un léger ralentissement de la croissance. A température égale, ce ralentissement est beaucoup plus accusé sous la neige que dans les biotopes déneigés : il affecte principalement les premiers stades larvaires phytophages, qui ne se développent pratiquement pas en absence de périphyton. La taille des larves et des adultes est fonction de la longueur du cycle biologique.

Quarante-deux espèces de Plécoptères, seize espèces d'Elminthidac et cinq espèces d'Hydraena ont été capturées dans seize stations situées sur la partie amont du Lot et sur son principal affluent, la Truyère. En aval, les débits estivaux sont très perturbés par le fonctionnement des usines hydro-électriques. Ces perturbations éliminent la plupart des Plécoptères, puis les Coléoptères. Toutefois, deux Leuctra automnales, L. fusca et L. geniculata, se maintiennent dans cette zone. Des données morphologiques sont précisées pour certaines espèces de Plécoptères.

Plus de 90 % des invertébrés entraînés à l'entrée du système restent piégés dans le milieu souterrain. L'afflux le plus important se produit pendant les premiers jours de crue ; il en est de même pour la matière organique globale transportée par litre d'eau. La matière organique en particules grandes et moyennes est la fraction la mieux représentée à l'entrée du système. Inversement, la matière organique dissoute est la fraction la plus abondante à la sortie.